Ο χορός αυτός λέγεται οτι προέρχεται απο τους Ζεϊμπέκηδες, Έλληνες από τη Θράκη, που μετανάστευσαν στην Προύσα και το Αϊδίνι της Μικράς Ασίας.
Με τη Μικρασιατική καταστροφή, οι απόγονοι των Ζεϊμπέκηδων έφεραν το χορό αυτό στην Ελλάδα.
Ο ζεϊμπέκικος, αρχικά, ήταν καθαρά αντρικός χορός, αργός και βαρύς, που αρχικά περιλάμβανε και την επίδειξη οπλομαχητικής, κάτι συνηθισμένο στους τοπικούς χορούς της Θράκης, της Μακεδονίας και του Πόντου. Εξελίχθηκε όμως και άλλαξε με τα χρόνια, διατηρώντας πάντα τα βασικά χαρακτηριστικά του και το μοναδικό και τόσο χαρακτηριστικό ρυθμό του που είναι τα 9/8.
Είναι ένας χορός βασισμένος στον αυτοσχεδιασμό, έτσι ώστε, αν ο χορευτής ξέρει τα βασικά βήματα και μπορεί να ακολουθήσει τον ρυθμό, σε λίγο μόνο χρόνο, μπορεί να χορεύει βάζοντας το δικό του στύλ.